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軟件介紹
PrimerPlex是一種高效且復雜的工具,用于設計多重PCR的引物。多重分析有助于在單個反應容器中擴增多個目標,從而減少試驗時間和成本。
用于多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的寡核苷酸設計
多重PCR的引物設計存在若干挑戰,包括引物二聚體、無法分離具有相似電泳遷移率的擴增子以及因與非目標DNA模板的非特異性結合而導致的錯誤引物。PrimerPlex采用專有算法,在統一的反應條件下為100多個序列設計理想的多重引物組。引物組是在篩選了池中的全部引物并盡量減少Tm錯配后確定的,以確保特定的擴增和高信號強度。在這個過程中,它在幾秒鐘內分析了數百萬個可能的多重引物集,并提出了一個備用集的清單。你可以*所設計的引物對之間的minimum產物大小差異,以便在凝膠上好地顯示條帶。為了**引物的特異性,引物可以從PrimerPlex與NCBI的任意基因組數據庫進行BLAST搜索。
對于SNP基因分型研究,PrimerPlex設計了SNP側翼引物。結果包括每個DNA模板的引物對,包括產物大小、退火溫度和其他物理化學寡核苷酸特性。二級結構的圖形顯示也可以幫助確定它們是否會阻礙反應。
多重PCR檢測用于基因表達分析(使用凝膠電泳的終點檢測)、高通量SNP應用(例如基因分型)、下一代測序所需的目標富集、病原體檢測、菌株分型和單倍體分型。PrimerPlex還為高通量SNP基因分型分析設計了理想等位基因特異性捕獲探針和等位基因特異性引物延伸 (ASPE) 引物。
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北京環中睿馳科技有限公司(簡稱北京睿馳科技)成立于2011年,是一家從事軟件代理和軟件開發的公司。在過去十余年的不斷發展中,公司堅定了以科研軟件代理為戰略導向,以**研發為**的發展目標,樹立了“睿于心,馳于行”的企業文化。目前,公司科學軟件事業部已與國內外數百家科研軟件的研發公司建立了合作關系,產品涵蓋教育、醫療、交通、環境、消防、金融、航空航天等領域。迄今為止,公司先后已服務于國內數千所大學、科研機構、大型企事業單位。公司以科研軟件售前售后服務為基礎,追求進步與發展。2018年成立研發事業部,自主開發具有自主知識產權的科研領域相關軟件。如今,公司已發展成為一家擁有一個子公司、一家分公司和一個辦事處的高科技企業。北京睿馳科技秉承自己的嚴謹、認真、熱情的,為廣大客戶提供周到、滿意的技術支持服務和幫助。