新高考尊重學生的自主選擇權，讓學生根據自己的興趣特長、職業發展取向和未來人生規劃自主選擇部分科目，但實際上學生選課走班的自覺意識和能力不夠，存在很大盲目性。一是表現為不少學生選課時感到茫然與焦慮。二是表現為學生選課走班存在功利性。部分學生在確定自己的選考科目時，會優先考慮那些簡單的、容易得高分的科目，或者主要依據“目前成績”來確定選課科目，而對選課必須考慮的“外部因素”，如大學要求和“長遠目標”缺乏必要的重視。很顯然，這種功利性的選課走班由于沒有考慮各科目的內在學習規律，學生在經歷高強度的學習后，往往會對一些科目逐漸失去興趣，產生較多的負面情緒，甚至影響身心健康發展。另外，這種功利性的選課走班對學生未來的專業學習和職業發展有可能造成不必要的消較影響。三是表現為學生選課走班存在一定的隨意性。很多學生在聽取他人對選考科目的介紹時，僅憑“一時興起”的激情或者對某個教師的喜好選擇高考科目，認為只要自己不排斥的科目和教師就是好的選擇，然而這種激情是難以持久的，接下來的學業困難甚至會產生“適得其反”的后果，讓學生忘記選課時的“初心”，以致后期的學習行為變得倉促混亂。
選課走班相比傳統課堂，更關注學生的因材施教與個體發展，聚焦點放在那些被教師“遺忘的角落”，克服了傳統課堂中有的學生“吃不飽”、有的學生“吃不了”的弊端。但現實中存在著有的學校選課走班教學不徹底的形式化現象。一是學校課程選擇范圍很有限。部分學校在實施選課走班過程中，沒有科學設置可供學生選擇的課程，學校課程結構簡單，學生自由選課的熱情和空間受到很大限制，致使選課走班教學的功能大打折扣。二是選課走班實施過程太保守。有些學校或只是進行了選修課程“淺嘗輒止”的選課走班，沒有推進必修課程“全面實質”的選課走班，或只是在形式上做到多樣化，沒有考慮學生全面發展問題。例如，有學校語文課程僅以體裁類型作為走班依據，把學生分為小說、散文、詩歌、寫作等不同組別進行走班，這與普通高中已有的素質拓展課程沒有實質區別，在某種程度上曲解了新高考下選課走班的真正內涵。三是部分教師出現消較和倦怠行為。選課走班的施行不僅增加了班級數，改變了現有教學的“一鍋端”，而且學生還擁有自主選擇教師的權利，同時教師還面臨著素質提高的挑戰，大大增加了教師的工作負擔和心理壓力，從而使不少教師在教學上出現消較和倦怠行為，對選課走班打馬虎眼，這嚴重影響了選課走班的教學質量。這種現象在資源不充分的學校表現得更加明顯。
選課走班教學給普通高中教學管理帶來不小沖擊，增加了學校教育教學管理的難度。一是教師常規管理復雜化。選課走班實施后每位教師要針對不同學情進行有差別的教學設計和實施，因此教師的集體備課、交流學習、教研組活動和教學評價等教學生活與教學管理架構都需重構。二是師生有效溝通存在障礙。選課走班教學下，行政班中教師可以將學生“對號入座”，但在教學班中，教師面對的學生不斷變化和成倍增長，而有的教師又缺乏把“我的學生”變成“我們的學生”的理念。三是學生學習管理復雜化。實行選課走班讓教學班、行政班并存成為學校管理常態，卻出現行政班管理職能弱化、教學班集體觀念淡薄的現象，這會使兩類班級的紀律、考勤、作業、輔導都變得困難，尤其是教學班。四是學生德育出現“空檔”。選課走班制下，由于學生的流動，行政班班主任只能對學生實行“間斷性”的德育管理，而教學班教師又基本無暇顧及學生的德育問題，這就容易出現學生德育的空白地帶。五是選課走班空間設施管理細碎化。選課走班擴大了學生與外界的互動范圍，*、大面積的走班更是對學校整體的硬件資源提出挑戰，大到教室的格局、小到桌椅的布置都要推翻再來。

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