有機肥料雖然有許多優點，但也有不足。現將有機肥料與化學肥料的特點比較如下：
1、有機肥料含有機質多，有顯著的改土作用；而化學肥料只能供培植物礦質養分，一般無改土作用。
2、機肥料含有多種養分，有*肥料之稱；而化學肥料養分種類比較單一。
3、有機肥料養分含量低，尤其是肥料中氮的當年利用率（29% - 30%）低，施用量相當大，需要較多的勞力和運輸力量，而化學肥料養分含量高。 用量少。
4、有機肥料所古養分大多數為有機態，供肥時間長，但供應數量少，肥效緩慢，而化學肥料肥效快．供應數量較多，能夠及時滿足植物對養分的需要，但肥效不能持久。

5、有機肥料既能促進植物生長，又能保水保肥，而化學肥料養分濃度大，*揮發、淋失或發生強烈的固定，降低肥料利用率。

土壤結構性對土壤水分狀況同樣有著深刻的影響。團粒結構與土壤有機質含量和施用的有機肥料數量有關．水穩性團粒結構能**土壤表層的疏松性，利于土壤透水。這種結構的特點是團聚體疏松，非毛管孔隙度大，因而能減低土壤中水分毛管運動的高度和速度，減少土壤表面水分蒸發．團粒性結構較好的土壤顆粒結構半徑較其差的土壤顆粒粒結構半徑為大，而毛管水上升運動速度與結構單位的半徑成反比．毛管水運動速度較侵，土壤水分狀況得到了調節。

所以增施有機肥料能夠減低水分蒸發，提高土壤的含水量。間接的加強了農作物的抗旱能力。同時，土壤有機質的增加也提高了土壤微生物的數量，土壤生物活性較強，生物化學過程也比較活躍。因而，促進土壤中各種元素的生物轉化作用，提高農作物養分吸收.

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