全藏共分正藏和續藏兩類。正藏共485函，以千字文編號，從“天”至“漆”，分為大乘五大部經、五大部外重單譯經、小乘《阿含經》及重單譯經、宋元入藏諸大小乘經、大小乘律和續入藏諸律、大小乘論、宋元續入藏諸論、西土圣賢撰集八個部門；續藏共239函，是《此土著述》一部門，編號從“書”至“機”；以上正續兩藏總計724函，724卷，實際收錄元、明、清三代高僧大德的經、律、論、雜著等167種“外有全藏目錄五卷”。